Вологда нь ижил нэртэй голын баруун эрэг дээр байрладаг бөгөөд энэ хотыг Сухона, Шексна голын сав газраар Архангельсктэй холбосон эртний усан зам юм.
Түүхийн эх сурвалжид энэ хотыг анх XII зуунд дурдсан байдаг. 15 -р зуунд Вологда хотыг Великий Новгород захирч байв. 1462 оноос хойш хорин жилийн турш Вологда нь ханхүүгийн төв байсан боловч 1481 оноос Москвагийн ноёдын захиргаанд орсон бөгөөд захирагч нь тухайн үед Иван III байв.
1565 онд Иван Грозный Вологда хотод хоёр дахь опричина оршин суух газар байгуулахаар шийджээ. Тэр энд чулуун Кремль, цайз барихыг хүсчээ. Мянга мянган гар урчууд, тариачдыг Вологда руу маллаж, барилгын ажлыг англи инженер Х. Локк удирдсан. Төлөвлөгөөнд Кремль нь тэгш өнцөгт хэлбэртэй байв. Хойд талд нь Вологда голоор хамгаалагдсан бөгөөд хоёр талаас нь устай суваг ухжээ. Гэвч 1571 онд Крым хааны дайралт, Вологдагаас эхэлсэн тахал IV Иваныг Москвад буцаж ирэхэд хүргэв. Хаан явснаар барилгын ажил зогссон.
Ноцтой бэхлэлт байхгүйн улмаас Вологда 1612 онд Польш-Литвийн армийн довтолгооноос ихээхэн хохирол амссан. Гэхдээ хотыг хурдан сэргээж, бүр хуучин хэмжээнээс нь хэтрүүлэв. 17 -р зууны эцэс гэхэд Вологда хотын түүхэн төв нь Хот, Верхний Посад, Нижний Посад, Заречье гэсэн дөрвөн хэсгээс бүрдсэн байв. Гэсэн хэдий ч 18 -р зууны эхээр Санкт -Петербург хот байгуулагдаж, Балтийн тэнгис дэх худалдаа хөгжсөнтэй холбоотойгоор Вологда хотын эдийн засгийн байр суурь бага зэрэг суларчээ.
1708 онд Вологда Архангельск мужид нэгджээ. Гэхдээ аль хэдийн 1719 онд энэ хот Вологда мужийн төв болж, 1796 онд 1929 он хүртэл оршин байсан Вологда мужийн төв болжээ.
19 -р зуунд энэ хот сэхээтнүүдийн олон гишүүдийн улс төрийн цөллөгийн газар болжээ. 1918 онд Вологда 5 сарын турш Оросын "дипломат нийслэл" -ийн дүрд тоглосон. Брестийн энхийн гэрээ байгуулагдсаны дараа АНУ, Их Британи, Франц, Япон, Хятад, Бразил гэх мэт 11 томоохон мужийн элчин сайдын яам, төлөөлөгчийн газрууд энд түр нүүжээ.
Одоо Вологда бол оросууд болон гадаадын жуулчдын очдог алдартай аялал жуулчлалын төв юм.
